В 1989 году директором завода стал Виктор Рабигольдович Шрайдер, перешедший на эту должность с поста заместителя директора по коммерческим вопросам. На его руководство пришлись наиболее сложные годы за весь период работы завода. Шла перестройка, разделился на независимые государства Советский Союз. Вслед за тем наступил глубокий экономический кризис.

Завод тяжело переживал трудные времена. Стало понятно, что во всей стране рухнула система взаимозачетов, появлялась система предоплаты. На заводе начались задержки зарплаты, специалисты увольнялись. Нужно было искать выход из положения, чтобы сохранить ядро коллектива и действующее производство. Были выделены средства на рекламу, на ЭМСС появились первые бригады, выезжавшие в поисках заказов в разные регионы страны.

Прорабатывался вопрос аренды предприятия. И в июле 1991 года делегаты конференции трудового коллектива единогласно проголосовали за то, чтобы дать разрешение на аренду предприятия. Председателем Правления был избран Виктор Шрайдер. Впервые за время хозяйственной деятельности завод вышел на безубыточную работу. 21 ноября 1991 года завод был включен в государственный реестр Украины, как «Арендное предприятие «Энергомашспецсталь».

По итогам восьми месяцев работы была получена прибыль. Заводчанам была выплачена премия ко Дню Машиностроителя. По результатам работы в 1991 году провели ряд мероприятий, направленных на повышение социальных гарантий заводчан. Зарплата была увеличена на 60% и начислялась с коэффициентом индексации, были введены дополнительные выплаты на проезд в городском транспорте и на питание в столовой. Также дополнительными выплатами компенсировались резкие скачки инфляции. Правилом на заводе стали денежные выплаты, упреждающие каждое очередное повышение цен на товары.

Основное производство работало неудовлетворительно, объем производства сократился втрое. Завод работал в строгом режиме экономии энергетических и материальных ресурсов.

В 1991 году выпуск товаров народного потребления стал важной частью работы завода. Годовой оборот продажи таких товаров достиг 4,6 млн рублей. Три четверти всех выпускаемых товаров народного потребления отправлялось в Россию. Но спрос на такие товары был небольшим, и многое залеживалось на складах.

Для стабилизации положения администрация принимала ряд мер. Директор добился от Совета Министров разрешения установить цену на слитки с уровнем рентабельности не выше 25%. Для погашения задолженности по зарплате (долг предприятия составлял 25 млн руб.) директор взял двухлетний кредит в «Авто Банке» в 26 млн рублей. Был вдвое увеличен экспорт продукции, благодаря чему была погашена кредитная задолженность. Но вскоре, в связи с повышением цен на сырье и материалы, поставки продукции на экспорт становятся невыгодными.

Из-за финансовых проблем с завода уходили высококвалифицированные кадры, что только усугубляло сбои в производственном процессе. Оставались только те, кто был по-настоящему предан заводу и своему делу. Несмотря на трудности, специалисты ЭМСС держали марку. В 1994 году в КПЦ-1 бригадой Виталия Ильича Нещерета была изготовлена поковка для опытной обечайки корпуса атомного реактора ВПБР-600. Наружный диаметр поковки составил 6140 мм. В Украине на то время таких обечаек еще никто не делал.

Но кризис в стране усугублялся и продолжал оказывать влияние на деятельность предприятия. Резкий скачок цен на энергоносители, дисбаланс экономических связей, разрушение финансово-кредитной системы вызвали всеобщий кризис платежеспособности и значительное падение объемов производства. В результате затормозилась реализация произведенной продукции, выросла дебиторская задолженность, сократилась возможность своевременно оплачивать счета за поставленные энергоносители, приобретать сырье, выплачивать зарплату. В связи с указанными обстоятельствами подразделения предприятия временно перешли на сокращенный режим работы и были введены лимиты на потребление энергоресурсов.

Наблюдались проблемы с вводом в эксплуатацию КПЦ-2. Строительство тормозилось по вине строителей – треста «Донмашстрой» и комбината «Донецктяжстрой». Сроки сдачи фундамента пресса многократно срывались, из-за чего завод заплатил государству многомиллионные штрафы.